image: Variant-level pleiotropy and functional enrichment of shared genetic signals: osteoporosis and schizophrenia
Credit: Feng Liu
TIANJIN, CHINE, 6 janvier 2026 -- Une investigation génétique exhaustive dirigée par le Dr Feng Liu à l'Hôpital Général de l'Université Médicale de Tianjin a mis au jour des connexions moléculaires remarquables entre la schizophrénie et la santé osseuse, identifiant 195 loci génétiques partagés qui pourraient expliquer pourquoi les patients psychiatriques présentent des risques élevés de fractures. La recherche, publiée dans Genomic Psychiatry, a analysé les données génomiques de plus d'un demi-million d'individus et révèle que ces deux pathologies apparemment sans rapport partagent une machinerie biologique fondamentale au niveau moléculaire.
Cette découverte revêt une importance clinique immédiate. Les patients atteints de schizophrénie développent une ostéoporose à des taux largement supérieurs à ceux de la population générale, mais les cliniciens manquaient d'explications génétiques pour ce schéma préoccupant. Désormais, avec 1376 gènes codant pour des protéines cartographiés dans des régions de risque partagé, les chercheurs disposent d'une feuille de route moléculaire qui pourrait transformer les soins préventifs pour les patients psychiatriques vulnérables.
Le défi scientifique
Pourquoi un trouble de la pensée et de la perception partagerait-il des racines génétiques avec une maladie de fragilité osseuse? Ce paradoxe intrigue les chercheurs depuis des décennies. Les études épidémiologiques ont systématiquement documenté que les individus atteints de schizophrénie présentent une densité minérale osseuse plus faible et subissent plus de fractures que les témoins appariés. La carence en vitamine D, les perturbations métaboliques et les médicaments antipsychotiques ont tous été incriminés. Pourtant, ces explications semblaient incomplètes.
Le génome humain contenait des indices que l'observation clinique traditionnelle ne pouvait jamais détecter. La schizophrénie comme l'ostéoporose sont des pathologies hautement héritables, chacune influencée par des milliers de variants génétiques dispersés à travers les chromosomes. Si même une fraction de ces variants se chevauchait, cela suggérerait des fondements biologiques partagés bien plus profonds que les facteurs environnementaux ou les effets secondaires des médicaments.
Les tentatives précédentes de quantifier ce chevauchement ont donné des résultats mitigés. Les méthodes standard comme la régression du score de déséquilibre de liaison ne capturaient que des corrélations moyennes à travers le génome, passant potentiellement à côté de points chauds régionaux de risque partagé. Le domaine nécessitait des approches analytiques suffisamment sophistiquées pour détecter le partage génétique même lorsque les variants exerçaient des effets opposés sur différents traits.
Des méthodes computationnelles novatrices pourraient-elles révéler ce que les analyses plus simples dissimulaient?
Approche révolutionnaire
L'équipe du Dr Liu a assemblé un arsenal analytique sans précédent dans ce domaine de recherche. Elle a combiné trois méthodes génomiques complémentaires, chacune sondant le chevauchement génétique à une résolution différente. MiXeR a quantifié le chevauchement polygénique global à travers tout le génome. LAVA a examiné les corrélations génétiques locales au sein de régions chromosomiques spécifiques. Le cadre du taux de fausse découverte conditionnel/conjonctif a identifié les variants individuels associés aux deux pathologies simultanément.
La base de données s'est révélée tout aussi impressionnante. Les statistiques sur la schizophrénie provenaient de l'étude historique du Psychiatric Genomics Consortium portant sur 130 644 individus. Les données relatives à l'ostéoporose englobaient six phénotypes mesurés dans des cohortes allant de 8 143 à 426 824 participants. Les mesures de densité minérale osseuse couvraient plusieurs sites squelettiques: corps entier, colonne lombaire, col fémoral, avant-bras et talon.
Cette stratégie multiniveaux offrait des avantages que les approches à méthode unique ne pouvaient égaler. Là où les analyses globales auraient pu moyenner les signaux régionaux, les tests de corrélation locale les préservaient. Là où les méthodes traditionnelles exigeaient des directions d'effet concordantes, MiXeR détectait le partage indépendamment du fait que les variants augmentaient ou diminuaient le risque de maladie. La combinaison a créé un portrait tridimensionnel de l'architecture génétique impossible à obtenir à travers une seule lentille analytique.
La rigueur statistique est demeurée primordiale tout au long. L'équipe a exclu les régions génomiques présentant des schémas de liaison complexes susceptibles de générer des signaux fallacieux. Elle a appliqué les corrections de Benjamini-Hochberg pour contrôler les taux de fausses découvertes. L'ajustement du modèle a été évalué à l'aide des statistiques du Critère d'Information d'Akaike. Ces précautions ont garanti que les associations identifiées reflétaient une biologie authentique plutôt que des artéfacts statistiques.
Schémas inattendus à travers les sites squelettiques
Les résultats ont révélé un partage génétique plus complexe et spécifique au site que quiconque ne l'avait anticipé. Tous les os ne racontaient pas la même histoire.
La densité minérale osseuse du talon a émergé comme le partenaire dominant dans le chevauchement génétique avec la schizophrénie. L'analyse a identifié 140 loci génomiques partagés pour cette seule paire de traits, éclipsant les chiffres pour les autres sites squelettiques. Quarante-quatre régions génomiques ont montré des corrélations génétiques locales significatives entre la schizophrénie et la DMO du talon, avec des nombres à peu près égaux d'associations positives et négatives.
La DMO du corps entier a contribué 41 loci partagés. La DMO de la colonne lombaire et du col fémoral ont chacune apporté des contributions plus petites mais significatives. La paire diagnostique schizophrénie-ostéoporose a révélé 495 variants partagés influençant les traits, le chevauchement absolu le plus élevé observé.
La densité minérale osseuse de l'avant-bras a présenté une absence frappante. Zéro loci génétiques partagés ont émergé pour ce site squelettique. S'agissait-il d'une limitation de puissance due à des tailles d'échantillon plus réduites (seulement 8 143 participants), ou l'avant-bras manque-t-il véritablement de connexions génétiques avec le risque psychiatrique? Des études futures avec des cohortes plus importantes de DMO de l'avant-bras devront résoudre cette question.
Les directions d'effet ont ajouté une autre couche de complexité. Seuls 21% à 68% des variants partagés ont montré des effets concordants entre les paires de traits. Cela signifie que de nombreux variants génétiques qui augmentent le risque de schizophrénie diminuent simultanément la densité osseuse, tandis que d'autres poussent les deux traits dans la même direction. De tels schémas d'effets mixtes expliquent pourquoi les études précédentes de corrélation à l'échelle du génome ont produit des résultats modestes malgré un chevauchement génétique sous-jacent substantiel.
Mécanismes moléculaires éclairés
L'annotation fonctionnelle a transformé les coordonnées génétiques en signification biologique. Les 195 loci partagés ont été cartographiés sur 1376 gènes codant pour des protéines, et ces gènes ne se sont pas dispersés aléatoirement à travers les voies biologiques.
L'analyse d'enrichissement a révélé 59 termes de processus biologiques significativement surreprésentés. Le métabolisme des composés organoazotés figurait en tête de liste. Ces voies régissent le traitement des acides aminés et la manipulation des molécules contenant de l'azote, fonctions essentielles pour la synthèse des neurotransmetteurs dans le cerveau et la production de protéines matricielles dans l'os. La même machinerie moléculaire qui construit les molécules de signalisation synaptique construit également l'échafaudage collagénique du tissu squelettique sain.
Le développement des structures anatomiques est apparu de manière proéminente parmi les termes enrichis. Cette catégorie englobe les programmes génétiques qui guident la formation des tissus pendant le développement embryonnaire et maintiennent l'architecture tissulaire tout au long de la vie. Le cerveau comme l'os nécessitent des processus de développement orchestrés avec précision, et les variants affectant ces programmes pourraient plausiblement influencer les deux organes.
Les voies de régulation biologique ont complété le tableau. Ces catégories larges englobent les cascades de signalisation et les boucles de rétroaction qui coordonnent le comportement cellulaire à travers les systèmes d'organes. Les processus métaboliques du phosphore, les voies cataboliques et la biosynthèse des composés azotés cellulaires ont tous atteint la significativité statistique.
Ces voies partagées représentent-elles de véritables mécanismes causaux, ou simplement des associations statistiques? Les données ne peuvent distinguer la causalité de la corrélation. Néanmoins, la cohérence biologique des voies identifiées suggère une pertinence fonctionnelle plutôt qu'un chevauchement fortuit.
L'équipe derrière la découverte
Cette investigation a nécessité une expertise couvrant la génétique psychiatrique, la biologie squelettique et les méthodes computationnelles avancées. Le Dr Li-Ning Guo, le Dr Qi An et le Dr Zhi-Hui Zhang ont contribué à parts égales en tant que premiers auteurs, reflétant l'intensité collaborative requise.
Le Dr Feng Liu à l'Hôpital Général de l'Université Médicale de Tianjin a servi d'auteur correspondant aux côtés du Dr Meng-Jing Cai à l'Hôpital Populaire Provincial du Henan et du Dr Zhi-Jian Wei à l'Hôpital Qilu de l'Université du Shandong. Ce partenariat multi-institutionnel a réuni une expertise en radiologie, orthopédie et génomique psychiatrique à travers trois grands centres médicaux chinois.
Le financement du Fonds des Sciences Humaines et Sociales du Ministère de l'Éducation de Chine, de la Fondation Nationale des Sciences Naturelles de Chine et du Projet de Construction des Disciplines Médicales Clés de Tianjin a soutenu ce travail. La recherche illustre comment un investissement ciblé dans la psychiatrie computationnelle peut produire des connaissances inaccessibles par les approches cliniques traditionnelles.
Implications cliniques et potentiel de prévention
Ces découvertes arrivent avec une pertinence translationnelle immédiate. Les psychiatres traitant des patients atteints de schizophrénie pourraient éventuellement intégrer des scores de risque génétique pour la santé osseuse dans la prise de décision clinique. Ceux portant des variants à haut risque aux loci partagés pourraient recevoir une surveillance proactive de la densité osseuse et une intervention plus précoce.
Les données soulèvent également des questions concernant la sélection des médicaments. Si certains variants génétiques prédisposent à la fois à la schizophrénie et à la fragilité osseuse, certains médicaments antipsychotiques interagissent-ils davantage avec ces voies que d'autres? Des approches pharmacogénomiques pourraient-elles optimiser la sélection du traitement pour minimiser les effets secondaires squelettiques chez les patients génétiquement vulnérables?
Le dépistage à l'échelle de la population représente une autre possibilité. À mesure que la notation du risque polygénique mûrit, des évaluations intégrées capturant à la fois la vulnérabilité psychiatrique et squelettique pourraient identifier les individus justifiant des soins préventifs complets couvrant plusieurs systèmes d'organes.
Quels biomarqueurs pourraient aider à traduire ces découvertes génétiques en outils de chevet? Des analyses sanguines spécifiques pourraient-elles capturer le dysfonctionnement métabolique sous-jacent aux deux pathologies? Ces questions attendent des investigations futures.
Limites et mises en garde
La reconnaissance honnête des contraintes renforce plutôt qu'elle n'affaiblit ces conclusions. Tous les individus analysés étaient d'ascendance européenne, ce qui limite la généralisabilité à d'autres populations. Des études transéthniques devront déterminer si les chevauchements génétiques identifiés se répliquent à travers divers contextes génétiques.
Les six phénotypes liés à l'ostéoporose, bien que complets, peuvent ne pas capturer l'hétérogénéité biologique complète de la maladie squelettique. L'os cortical versus trabéculaire, les marqueurs de remodelage osseux et les résultats de fractures pourraient révéler des connexions génétiques supplémentaires non détectées ici.
Les contraintes de taille d'échantillon ont affecté spécifiquement les analyses de DMO de l'avant-bras. Le résultat nul pour ce site squelettique peut refléter une puissance statistique insuffisante plutôt qu'une absence véritable de chevauchement génétique.
Enfin, les statistiques sommaires GWAS ne peuvent détecter les variants rares, les interactions gène-gène ou l'interaction gène-environnement. L'architecture génétique complète reliant la schizophrénie et l'ostéoporose s'étend presque certainement au-delà de ce que les méthodes actuelles peuvent capturer.
La voie à suivre
Ces découvertes ouvrent des avenues de recherche s'étendant bien au-delà de l'investigation actuelle. Des études de randomisation mendélienne pourraient sonder les relations causales entre des gènes spécifiques et les résultats de maladies. Des modèles animaux pourraient valider si la manipulation des voies identifiées produit des phénotypes à la fois neuropsychiatriques et squelettiques.
Des essais cliniques testant des interventions protectrices de l'os spécifiquement dans les populations atteintes de schizophrénie représentent une autre extension logique. Si des mécanismes génétiques partagés conduisent la comorbidité, des stratégies de prévention ciblées pourraient s'avérer plus efficaces que des approches génériques.
L'équipe de recherche prévoit d'étendre les analyses à des pathologies psychiatriques supplémentaires. Le trouble bipolaire, la dépression majeure ou les troubles du spectre autistique partagent-ils des connexions génétiques squelettiques similaires? La cartographie du paysage plus large du chevauchement génétique cerveau-os pourrait révéler si la schizophrénie représente un cas unique ou exemplifie un schéma général.
Les efforts collaboratifs entre les communautés de recherche psychiatrique et musculosquelettique seront essentiels. La complexité découverte ici exige des approches interdisciplinaires combinant génomique, médecine clinique et biologie fondamentale.
Cette recherche représente une avancée significative en génomique psychiatrique, offrant de nouvelles perspectives sur les connexions biologiques entre la santé mentale et squelettique à travers une investigation génomique multiniveaux rigoureuse. Les découvertes ouvrent de nouvelles voies pour comprendre comment les variants génétiques influencent simultanément des systèmes d'organes disparates. En employant des approches analytiques innovantes combinant des méthodes globales, locales et au niveau des variants, l'équipe de recherche a généré des données qui non seulement font progresser les connaissances fondamentales mais suggèrent également des applications pratiques dans la stratification du risque et les soins préventifs. La reproductibilité et la validation de ces découvertes à travers le processus d'évaluation par les pairs garantissent leur fiabilité et les positionnent comme fondation pour des investigations futures. Ce travail illustre comment la recherche de pointe peut combler le fossé entre la science fondamentale et les applications translationnelles, impactant potentiellement les patients psychiatriques et les prestataires de soins de santé dans les années à venir. La nature exhaustive de cette investigation, couvrant de multiples méthodes analytiques et impliquant plus de 500 000 participants à travers des cohortes combinées, fournit des perspectives sans précédent qui remodèleront notre approche de l'intersection des maladies neuropsychiatriques et squelettiques. De plus, la collaboration interdisciplinaire entre radiologie, orthopédie et génétique psychiatrique démontre la puissance de combiner des expertises diverses pour aborder des questions scientifiques complexes.
L'Article de Recherche dans Genomic Psychiatry intitulé "Shared genetic architecture between schizophrenia and osteoporosis revealed by multilevel genomic analyses" est librement accessible via Open Access le 6 janvier 2026 dans Genomic Psychiatry au lien suivant: https://doi.org/10.61373/gp026a.0010.
À propos de Genomic Psychiatry: Genomic Psychiatry: Advancing Science from Genes to Society (ISSN: 2997-2388, en ligne et 2997-254X, imprimé) représente un changement de paradigme dans les revues de génétique en entrelaçant les avancées en génomique et génétique avec les progrès dans tous les autres domaines de la psychiatrie contemporaine. Genomic Psychiatry publie des articles de recherche médicale de la plus haute qualité de tout domaine au sein du continuum qui va des gènes et molécules aux neurosciences, à la psychiatrie clinique et à la santé publique.
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Journal
Genomic Psychiatry
Method of Research
Data/statistical analysis
Subject of Research
People
Article Title
Shared genetic architecture between schizophrenia and osteoporosis revealed by multilevel genomic analyses
Article Publication Date
6-Jan-2026
COI Statement
The authors declare no conflict of interest related to this study.