image: CRISPR 敲除筛选鉴定出的候选宿主基因 view more
Credit: ©《中国科学》杂志社
这项研究由中国内蒙古大学生命科学学院王国俊团队报道。牛副流感病毒3型(BPIV3)是牛呼吸道疾病的主要病原之一,也是牛呼吸道疾病综合征(BRDC)的核心组分,给全球养牛业造成巨大经济损失。为了解析BPIV3感染依赖的宿主机制,该团队在牛源细胞中建立了全基因组CRISPR/Cas9筛选体系。
研究人员采用未修饰的MDBK细胞,避免表型干扰;优化筛选条件,确保文库完整性。通过多轮致死性BPIV3感染,富集到关键宿主基因;后续验证发现,SLC35A1和LSM12敲除细胞的病毒复制显著降低,证实了筛选体系的可靠性。
“鉴定出这些关键宿主因子,不仅推动了 BPIV3 的研究进展,也明确了新型抗病毒靶点。” 本研究通讯作者王国俊表示,“我们建立的 CRISPR 筛选系统,为开展可靠的病毒与宿主互作研究奠定了坚实基础。”
唾液酸转运蛋白 SLC35A1 可调控细胞表面糖基化,是本次筛选中富集程度最高的候选因子。本研究证实其与 BPIV3 感染相关 — 敲除该基因可显著抑制 BPIV3 感染,这是因为 BPIV3 优先结合 α2,3 - 连接型唾液酸,且经唾液酸转移酶抑制剂处理后,BPIV3 感染被进一步抑制。
LSM12 是一种 NAADP 受体,通过 TPC 通道调控细胞内钙稳态,对 BPIV3 的内吞至关重要。机制研究进一步证实,细胞内 Ca²⁺稳态在病毒内化过程中发挥关键作用,这与 LSM12 介导 TPC 通道激活的已知功能一致:LSM12 与 NAADP 结合后,可调控 TPC 依赖的过程,为病毒入侵提供支持。后续实验发现,LSM12 敲除细胞中病毒与内体膜的融合被阻断;敲除细胞内的内吞货物降解减少,印证了该表型。
综上,本研究鉴定出两种 BPIV3 关键宿主因子:SLC35A1和 LSM12。这些发现为开发新型抗病毒策略(调控唾液酸水平、靶向 LSM12-TPC 信号通路)以抑制 BPIV3 感染提供了思路。
研究详情请见原文:
Genome-wide CRISPR/Cas9 knockout screen identifies host factors essential for Bovine Parainfluenza Virus Type 3 replication
原文链接:https://doi/10.1007/s11427-025-3142-x
Journal
Science China Life Sciences