小鼠的全结肠成像揭示了一个连续的结肠粘液系统；该系统在形成包封的粪便颗粒以及将其从结肠中清除时会在可能有害的肠道菌群与宿主组织间形成一种保护性的屏障。虽然还不清楚人类是否存在类似的结肠粘液系统，但了解结肠组织具有形成粘液屏障驱动因子的作用可能对研发针对肠道疾病（如结肠炎）的治疗干预措施有帮助。在哺乳动物中，肠道是密集多样的共生菌群的家园。居住在那里的数万亿个高度活跃的微生物在健康和疾病中都起着重要作用。宿主与微生物间的关系并不总是互惠的-许多常见类型的肠道菌群如果接触宿主组织会产生致病作用，从而导致感染和炎症。将肠道上皮与结肠环境中的众多危害物进行区隔的是一层薄薄的结肠粘液，后者被认为能调控宿主与微生物群间的相互作用。然而，很难弄清这种粘液系统在整段结肠中是如何形成及发挥功能的。Kirk Bergstrom和同事研发了一种全结肠成像法，它能分析小鼠结肠粘液的起源和组成，评估其在粪便排泄过程中保护宿主组织以屏蔽可能有害的肠道微生物的作用。Bergstrom等人发现，结肠粘液系统是由在不同结肠区域形成的两种不同类型的富含O-聚糖的粘液组成的。在粪便颗粒形成时，源自近端结肠的粘液会包封该粪便颗粒，从而在相关的微生物群和宿主间形成一种初级屏障。在粪便颗粒通过结肠时，在结肠远端区域产生的粘液会形成次级粘液层，它能帮助增强粘液屏障并促进排泄。George Birchenough和Malin Johansson在相关的《视角》中写道：“进一步研究该粘液系统如何在人的整个结肠中发挥功能至关重要，因为它能对日益增多的肠道疾病患者提供针对性的帮助。”
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