El análisis de las redes de interacción de proteínas revela factores cancerígenos hasta ahora

En tres estudios de la Cancer Cell Map Initiative (iniciativa del mapa celular del cáncer), los investigadores descubrieron interacciones hasta ahora desconocidas entre las proteínas que propician el cáncer y combinaron estos nuevos datos para generar un mapa de las vías proteicas que informan sobre los resultados del cáncer. Su enfoque ofrece un marco que podría mejorar la comprensión de los científicos de la progresión del cáncer y ayudar a identificar objetivos terapéuticos. Existe un amplio catálogo de mutaciones genéticas para muchos cánceres, ya que son enfermedades genéticas. Pero falta un mapa consolidado que organice estas mutaciones en vías que impulsen el crecimiento del tumor. «Se obtendría una imagen más clara si los mecanismos críticos para el crecimiento tumoral estuvieran mejor consolidados en vías específicas», escriben Ran Cheng y Peter K. Jackson, en un artículo de Perspective relacionado. «Identificar y consolidar estas vías y determinar cómo las combinaciones de vías propician el cáncer simplificará nuestra búsqueda de terapias eficaces contra la enfermedad». Las redes de interacción proteína-proteína (PPI) son herramientas importantes en este esfuerzo porque se extienden más allá de las listas de genes para definir la bioquímica de las proteínas de las vías tumorales y los objetivos susceptibles de ser tratados con fármacos. Danielle Swaney et al. estudiaron los datos de interacción proteínica en células escamosas de cabeza y cuello e informan de que estas líneas cancerosas mostraron cientos de interacciones distintas en comparación con las líneas no cancerosas y entre sí. Las interacciones con la vía de la PI3K, que suele mutar en los tumores, eran predictivas de la respuesta a los fármacos, notificaron Swaney y sus colegas. Minkyu Kim et al. se centraron en el cáncer de mama e identificaron dos proteínas relacionadas con el gen supresor de tumores BRCA1, así como dos proteínas que regulan el PIK3CA. Fan Zheng et al. combinaron los nuevos datos de PPI de Swaney et al. y Kim et al. con los datos públicos existentes para generar un mapa de vías proteicas que utilizaron para revelar mutaciones que antes eran difíciles de detectar y resultan potencialmente importantes en la metástasis tumoral. Los estudios proporcionan un recurso que será útil para interpretar los datos genómicos del cáncer.