对癌症基因组所做的大规模全基因组分析揭示了新型的罕见突变特征

据一项新研究披露，对1万2000多种癌症所做的大规模全基因组分析揭示了先前未报道过的突变特征，其中包括罕见的肿瘤特异性特征。这些发现不仅引入了每种癌症类型中常见的及罕见突变特征的概念，它们还凸显了如何用这些见解来加强个性化的癌症治疗和诊断。癌症基因组通常是一个扭曲的有数千个基因突变的融合。现代的全基因组测序（WGS）法可进行全面的癌基因组分析，揭示导致某特定癌症突变的特征性组合。这些模式也称为突变特征，它们可描述导致肿瘤发展的突变过程。迄今为止，已有许多癌症突变特征的报道。Andrea Degasperi和同事对1万2222例WGS癌症患者进行的突变特征分析大大丰富了这一知识库；这些患者由“英国全国卫生服务基因组医学中心”募自英国各地；他们是“英国基因组学100,000基因组项目”的一部分。将他们的结果与来自两个较小型、开放获取的癌症WGS数据集（即国际癌症基因组联盟和Hartwig医学基金会）进行比较后发现，Degasperi等人的分析总共涉及1万8000多例WGS癌症。虽然这些发现证实了许多以前报道过的突变特征，但该分析还确定了以前未知和罕见的突变类型，从而在当前的突变特征集合中添加了40个单碱基和18个双碱基的替换特征。作者证明，对每种肿瘤类型来说，癌症都可能有数量有限的常见突变特征和几种较为罕见的特征，后者在人群中的发生频率较低。该数据集还提供了癌症潜在起因的有关线索，如在环境中接触吸烟或紫外线或内在细胞故障等。